Bảo tàng Vrolik là nơi có một bô sưu tập lớn về các mẫu bệnh phẩm, phôi thai, xương và các đầu lâu khác thường, tất cả đều được lưu giữ lại bởi nhà khoa học Gerardus Vrolik (1755-1859). Vrolik là một trong những nhà khoa học người Hà Lan vĩ đại nhất thế kỷ 18 - 19.

Willem Vrolik cũng là người tiên phong trong lĩnh vực quái thai học, nghiên cứu về sự dị tật của con người, đây là một lĩnh vực phục vụ cho nghành y học thế kỷ 18 và 19. Ông cũng đã cho xuất bản nhiều sách chuyên khảo về sự dị tật của con người cũng như sưu tầm hàng nghìn mẫu bệnh phẩm và vật phẩm. 

Bảo tàng Torture hay còn gọi “bảo tàng tra tấn” là một minh chứng lịch sử ghi lại tội ác của con người đối với con người. Tất cả các hiện vật của bảo tàng được bố trí trong căn phòng nhỏ và tối tạo nên một bầu không khí ảm đạm, u ám.

Bảo tàng có nhiều hiện vật nổi tiếng đáng chú ý như máy chém, đinh vít ngón tay, cột bêu tội nhân, cưa, máy nghiền nát hộp sọ, ghế Judas, bánh xe Catherine … tất cả những vật dùng này đều dùng để tra tấn con người.

Tọa lạc gần Ga Trung Tâm Amsterdam, bảo tàng Sex thu hút hơn 500.000 lượt khách du lịch đến tham quan mỗi năm. Bảo tàng gồm nhiều bộ sưu tập phong phú và đa dạng về các vật phẩm tình dục của con người, bao gồm tranh ảnh nghệ thuật, tượng sứ, đĩa và nhiều vật dụng khác.

Bảo tàng ma túy, cần sa và chất gây nghiện là nơi trưng bày các chất gây nghiện và cung cấp cho du khách những thông tin về đặc tính và cách thức sử dụng chúng. Bảo tàng cũng tập trung giải thích việc các chất ma túy gây nghiện có thể được sử dụng như thế nào trong mục đích công nghiệp và nông nghiệp, thậm chí là các đồ dùng hàng ngày như quần áo, mỹ phẩm…

Khai trương vào tháng 9 năm 2011, bảo tàng hình xăm ở Amsterdam là một trong những bảo tàng mới nhất hiện nay. Bảo tàng này tái hiện lại nghệ thuật xăm hình lên da cùng với các hiện vật từ khắp nơi trên thế giới, bao gồm kim châm, biển hiệu cũ, tranh ảnh, da người, da thú vật…

Trong bộ sưu tập của bảo tàng có hơn 40 nghìn vật phẩm, bộ sưu tập này được bắt nguồn bởi Henk Schiffmacher. Các hiện vậy được phân loại và trưng bày theo khực địa lý nhưng châu Phi, Mỹ, châu Đại Dương và châu Á.

Bảo tàng KattenKabinet được thành lập chỉ dành riêng cho mèo. Bảo tàng được thành lập vào năm 1990 bởi William Meijer, ông là một người Hà Lan giàu có muốn thành lập bảo tàng để tưởng nhớ đến chú mèo Tom của ông.

Được thành lập năm 2007, bảo tàng ma chay Hà Lan chủ yếu trưng bày giới thiệu các đặc trưng văn hóa ma chay ở đất nước Hà Lan để tưởng nhớ những người đã qua đời. Bộ sưu tập trong bảo tàng gồm có rất nhiều các loại xe dùng trong tang lễ, một chiếc xe đẩy thuộc thế kỷ 19, các loại áo tang và cáo phó.

Ngoài ra, bảo tàng cũng trưng bày giới thiệt về các nghi thức ma chay từ vùng nông thôn đến đất hoàng gia trong nhiều thế kỷ.