Theo đó, nếu hồ sơ đề nghị của doanh nghiệp không đầy đủ, trong 3 ngày làm việc
kể từ ngày nhận hồ sơ, Cục Hải quan địa phương phải có văn bản thông báo
cho doanh nghiệp các nội dung sửa đổi, bổ sung, hoàn trả lại hồ sơ và
yêu cầu doanh nghiệp sửa đổi, bổ sung theo quy định.
Trong trường hợp hồ sơ của doanh nghiệp đủ điều kiện xét miễn thuế, miễn phạt hoặc xóa nợ thuế, xóa các khoản phạt chậm nộp, trong 10 ngày làm việc kể từ ngày tiếp nhận đủ hồ sơ, Cục Hải quan địa phương tiếp nhận hồ sơ giải quyết phải có công văn báo cáo, đề xuất ý kiến xử lý kèm toàn bộ hồ sơ của doanh nghiệp gửi Tổng cục Hải quan kiểm tra, trình Bộ Tài chính xem xét.
Mặt khác, nếu hồ sơ của doanh nghiệp không đủ điều kiện để xét giảm, hoặc miễn thuế, miễn phạt thì trong vòng 10 ngày làm việc kể từ ngày tiếp nhận hồ sơ, Cục Hải quan địa phương phải có văn bản trả lời và yêu cầu người nộp thuế nộp đủ tiền thuế truy thu và tiền phạt chậm nộp theo quy định.
Thông tư cũng quy định rõ, chỉ trừ công văn đề nghị miễn truy thu thuế, miễn phạt chậm nộp, xóa nợ thuế doanh nghiệp phải nộp bản chính còn các chứng từ còn lại doanh nghiệp chỉ cần nộp bản sao có đóng dấu sao y bản chính và chữ ký của đại diện có thẩm quyền của doanh nghiệp.
Thông tư có hiệu lực thi hành từ ngày 15/4/2012.
Tô Thành
